CEFRES bude v rámci doktorského programu, tak jak je již zvykem, zprostředkovávat zkušenosti s výzkumem založeným na evropské spolupráci, a to s cílem aktivního zapojení a dalšího vzdělávání mladých vědců. CEFRES nabízí dva hlavní programy na podporu mobility „mladých vědců“:
- Program Platformy CEFRES na podporu doktorského studia, určený dvěma doktorandům ročně, jejichž disertační práce jsou zaštítěny Akademií věd České republiky nebo Univerzitou Karlovou;
- Program na podporu mobility mladých vědců, určený doktorandům a postdoktorandům z Francie a ze tří zemí Visegrádské čtyřky (Maďarsko, Polsko, Slovensko) za účelem výzkumného pobytu v CEFRESu po dobu jednoho roku.
Každý doktorand přidružený k CEFRESu bude zaštítěn tutorem, kterého si může vybrat mezi výzkumnými pracovníky z ústavu nebo z jedné z partnerských institucí Platformy CEFRES – z Univerzity Karlovy a Akademie věd České republiky. Tutor nenahrazuje školitele doktoranda, ale doprovází a zaštiťuje doktoranda během jeho pobytu v CEFRESu.
Doktorandi přidružení k CEFRESU jsou povinni se podílet na aktivitách ústavu a jeho partnerů. Jejich práce jsou součástí globální vědecko-výzkumné politiky ústavu, konkrétně jedné z výzkumných os CEFRESu.
Od doktorandů se vyžaduje, aby během roku prezentovali vývoj svého výzkumného projektu v rámci doktorských seminářů a odborných setkání organizovaných ústavem a jeho partnery. Ústav podporuje doktorandy při organizování vědeckých událostí z jejich vlastní iniciativy a při jejich plném aktivním zapojení do vědeckých aktivit CEFRESu.
- Doktorandi zapsaní alespoň do 2. ročníku doktorského studia na Univerzitě Karlově nebo Akademii věd České republiky: Program Platformy CEFRES na podporu doktorského studia
- Postdoktorandi nebo doktorandi zapsaní alespoň do 2. ročníku studia na vysoké škole nebo ve výzkumném centru ve Francii nebo v jedné ze tří zemí Visegrádské čtyřky (Maďarsko, Polsko, Slovensko): Program na podporu mobility mladých vědců



