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Le Centre français de recherche en sciences sociales (CEFRES) a été créé par la France à Prague, en octobre 1991, pour jouer le rôle d’un observatoire des mutations politiques, économiques et sociales à l’œuvre après 1989 en Tchécoslovaquie, puis en République tchèque, et plus largement en Europe centrale.

Le CEFRES joue également un rôle de médiateur entre les milieux académiques français, tchèque et centre-européens, afin de contribuer à la structuration de l’espace européen de la recherche dans le domaine des sciences humaines et sociales.

C’est un établissement doté de l’autonomie financière depuis janvier 1993. Il a été est placé sous la tutelle conjointe de la Sous-direction des échanges scientifiques et de la recherche du ministère français des Affaires étrangères (MAE), d’une part, et de l’Institut des sciences humaines et sociales (InSHS) du Centre national de la recherche scientifique (CNRS), d’autre part. A l’instar de 26 autres centres à travers le monde, le CEFRES opère sous le statut d’unité mixte institut français de recherche à l’étranger (UMIFRE n° 13), s’inscrivant dans l’accord-cadre MAE-CNRS du 20 avril 2007. Le CEFRES est également une unité de service et de recherche (USR n° 3138) du CNRS, dont le premier contrat quadriennal a été renouvelé en juillet 2011.